Nel 2006, i tre Dipartimenti del Complesso di San Giovanni in Monte: Archeologia, Discipline Storiche e Paleografia e Medievistica, vista la contiguità disciplinare e di sede, hanno avviato un progetto pilota per la riorganizzazione integrata dei servizi comuni rivolti agli studenti e ai docenti. Questo "Cantiere di riorganizzazione" ha lo scopo di realizzare un modello strategico di condivisione dei servizi amministrativi, tecnici, bibliotecari delle tre strutture per migliorarne l'efficienza, ridurne i costi e ampliarne la gamma, mantenendo l'autonomia dei Dipartimenti.
I Servizi integrati del Complesso di San Giovanni in Monte (Servizio Amministrazione,Servizi Bibliotecari, Servizio Gestione Palazzo, Servizio Gestioni Speciali, Servizio Informazione, Orientamento, Comunicazione) offrono strumenti comuni, utili a docenti e studenti per lo svolgimento delle proprie attività.
All'interno del Complesso Monumentale di San Giovanni in Monte, si trova la prestigiosa Aula "Giorgio Prodi". Composta da due sale ed un chiostro esterno, è da sempre sede di Convegni, Congressi nazionali e internazionali ed è possibile prenotarla per organizzare eventi.
Progetti e attività di ricerca, seminari, scavi e missioni archeologiche, pubblicazioni, mostre, attività culturali, convegni e altro ancora sono una parte fondamentale delle attività del Complesso di San Giovanni in Monte. All'interno della sezione sono presentate le principali attività, divise per dipartimento ed è possibile cercare e filtrare quelle di proprio interesse.